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GEOM-Drugs
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新的生成模型EnFlow助力低能分子结构发现
研究人员开发了EnFlow,一种新颖的、用于分子结构发现的能量引导生成框架。该方法结合了基于流的一致性生成与显式能量景观建模,以有效识别低能分子构象。EnFlow将采样引导至这些低能区域,从而以最少的采样步骤准确识别基态结构。
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基于能量的模型生成物理上一致的分子
研究人员开发了 EBMol,一种用于生成物理上一致的 3D 分子的新型基于能量的模型。该模型在无需训练期间进行显式模拟的情况下学习原子加性势,并利用恢复场匹配目标。EBMol 在 QM9 和 GEOM-Drugs 基准测试中取得了最先进的性能,并为分子构型提供了原则性的质量度量。
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NEAT transformer以最先进的速度和准确性生成3D分子
研究人员开发了NEAT,一种用于3D分子生成的新型自回归集合Transformer。与依赖原子顺序的先前方法不同,NEAT将分子视为集合,并使用邻域引导的训练策略来确保排列不变性。这种方法使模型能够学习令牌的顺序无关分布,从而在QM9和GEOM-Drugs等数据集上实现最先进的生成质量,同时比现有方法快得多。