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English(EN) Harmonic Torsional Diffusion for Protein-Ligand Flexible Docking

新的谐波扭转扩散框架增强了蛋白质-配体对接

作者 PulseAugur 编辑部 · [1 个来源] ·

研究人员开发了 Harmony，一个用于蛋白质-配体柔性对接的新框架，该框架明确考虑了角度变量的周期性几何。与使用通用欧几里得头的先前基于扩散的模型不同，Harmony 使用在圆上学习到的谐波势来参数化扭转得分场。这种方法为旋转异构体运动引入了频率感知归纳偏置，从而在 PDBBind 基准测试中提高了配体姿态准确性和口袋重建。Harmony 还增强了 PoseBusters 数据集上生成的复合物的物理有效性，并已在 EBNA1 和 KRAS G12D 等特定结合位点上进行了演示。 AI

影响 这项研究可能导致药物发现和分子生物学模拟中更准确、更符合物理的预测。

排序理由 该集群包含一篇详细介绍新的分子对接计算方法的 ist 研究论文。[lever_c_demoted from research: ic=1 ai=1.0]

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报道来源 [1]

  1. arXiv cs.LG TIER_1 English(EN) · Maksim Zhdanov, Pavel Strashnov, Vladislav Kurenkov ·

    Harmonic Torsional Diffusion for Protein-Ligand Flexible Docking

    arXiv:2608.20366v1 Announce Type: cross Abstract: Molecular docking requires reasoning jointly about ligand pose and protein flexibility. Most diffusion-based docking models predict torsional updates with generic Euclidean heads that ignore the periodic geometry of angular variab…

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