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transcriptomics

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  1. RESEARCH · CL_233390 ·

    新框架创建亚细胞分辨率单细胞嵌入

    研究人员开发了一种新颖的多模态框架来创建亚细胞分辨率单细胞嵌入。该方法整合了RNA表达谱、蛋白质序列数据和蛋白质结构信息。通过利用交叉注意力架构,该框架模拟了不同亚细胞区室内的相互作用,与以往将细胞整体处理的方法相比,提供了更精细的细胞表示。

  2. TOOL · CL_128994 ·

    自然语言处理技术应用于生物序列分析的回顾

    一篇最新的综述文章探讨了自然语言处理(NLP)技术在分析基因组学、转录组学和蛋白质组学等生物序列数据中的应用。文章详细介绍了从word2vec到先进的transformer和hyena operator模型等各种NLP方法如何应用于DNA、RNA和蛋白质序列分析。文章还讨论了分词策略、模型架构以及在预测蛋白质结构、基因表达和进化关系方面的最新进展。文章强调,将NLP整合到生物信息学中是理解复杂生物过程的一个有前景的方向。