TCR--pMHC

EMBER框架在无复合物对接的情况下预测TCR-pMHC结合

研究人员开发了EMBER，一种用于预测T细胞受体（TCR）和肽-MHC（pMHC）结合的新型框架。与需要对接复合物的传统方法不同，EMBER分析独立折叠的TCR和pMHC结构，将它们编码为SE(3)-不变的残基图。这种方法绕过了复合物对接中固有的放置误差，从而提高了各种折叠工具的准确性和稳定性。与基于复合物的预测器相比，EMBER在预处理单体折叠方面所需的操作更少，因此具有计算优势。