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SurfSpec
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新的SurfSpec框架在没有脱靶数据的情况下提高了药物设计的特异性
研究人员开发了SurfSpec，这是一个用于基于结构的药物设计的新框架，通过分析配体与其目标口袋之间的几何不匹配来提高特异性。该方法在不需要了解脱靶结构的情况下，提供了特异性的下界。SurfSpec通过将配体迭代地生长到目标口袋的特定表面区域，从而提高了经验特异性，同时保持了具有竞争力的目标亲和力改进，这在CrossDocked2020测试集上得到了证明。
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SurfSpec框架利用几何不匹配提高药物先导化合物的特异性
研究人员开发了SurfSpec，一个用于基于结构的药物设计中先导化合物优化的新框架。该方法通过关注配体与其目标口袋之间的几何不匹配来提高特异性，而无需脱靶结构的信息。SurfSpec通过将配体生长到目标口袋表面的特定区域来迭代地优化配体，在CrossDocked2020测试集上展示了改进的经验特异性和竞争性靶亲和力改进。