SimpleDesign

SimpleDesign模型在单阶段联合设计蛋白质序列与结构

研究人员推出SimpleDesign，一种新颖的端到端蛋白质序列与结构联合设计模型。与以往的多阶段方法不同，SimpleDesign直接在数据空间中进行训练，使用单一阶段目标，该目标结合了序列的离散交叉熵和结构的回归目标。该模型采用混合Transformer架构来处理特定模态的处理，同时保持序列和结构之间的全局自注意力。SimpleDesign在超过200万个序列-结构对上进行训练，在联合设计和无条件生成基准测试中表现强劲。