Riemannian metric

PACE框架通过几何感知传输增强单细胞轨迹推断

研究人员开发了PACE，一种用于单细胞轨迹推断的新框架，该框架解决了从时间序列快照重建细胞动力学固有的不适定性问题。PACE通过构建各向异性黎曼度量来利用几何感知方法，以更好地对齐不同实验时间点的细胞，并考虑异步发育。该方法改进了跨时间耦合，并在快照之间拟合神经桥，最终将这些动力学提炼成连续时间速度场。在多个数据集上的评估表明，与现有方法相比，PACE具有更优越的重建性能和改进的RNA速度对齐。