Residual Interaction Tokenization (RIT)

新框架 ORBIT 探究蛋白质适应性景观中的复杂相互作用

研究人员开发了 ORBIT 框架，用于分析蛋白质适应性景观中的复杂相互作用。该方法区分了相互作用的存在、表示能够访问它们的程度以及实现的功能恢复。ORBIT 在合成景观和 GB1 适应性景观上进行了测试，并比较了各种机器学习模型，包括标准的 MLP 和新颖的残差交互 Tokenization (RIT) 方法。虽然 RIT 在 Token 阶段显示出改进的成对可访问性，但更深的 MLP 在高阶相互作用的预测和功能恢复方面表现更好。