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Reactome
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新方法rwMagLap识别无节律垂体基因的昼夜节律调节因子
研究人员开发了一种名为rwMagLap的新方法，用于识别缺乏清晰24小时节律的垂体激素基因的潜在昼夜节律调节因子。该技术构建了一个节律基因图谱，并结合了与相位相关的（phase-aware）信息来对潜在的调控靶点进行排名。将rwMagLap应用于垂体数据后，成功识别出已知昼夜节律基因集的显著富集，表明其在计时药理学和计时治疗策略中的应用潜力。
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PPI-Net 模型将蛋白质相互作用与疾病过程联系起来
研究人员开发了 PPI-Net，这是一种新颖的图神经网络，旨在将蛋白质相互作用与功能性疾病过程联系起来。该分层模型整合了蛋白质-蛋白质相互作用网络和通路表示，使用图注意力将基因级信号聚合到更高级别的生物程序中。PPI-Net 在各种癌症类型中表现出强大的预测性能，实现了超过 90% 的平衡准确率，并通过恢复典型的致癌模块为癌症生物学提供了机制性见解。