RCSB protein data bank
PulseAugur coverage of RCSB protein data bank — every cluster mentioning RCSB protein data bank across labs, papers, and developer communities, ranked by signal.
2 天有情绪数据
-
新的ZetaDial方法精确控制蛋白质结合物的电荷以用于药物开发
研究人员开发了ZetaDial，一种在治疗开发推理阶段控制蛋白质结合物净电荷的新颖方法。该技术将后采样割线控制器与ProteinMPNN管道集成，与现有方法相比，提供了更精确的蛋白质电荷调整方式。ZetaDial在基准数据集上显示电荷预测的平均绝对误差显著降低，但也表明较大的电荷调整可能会影响蛋白质的可折叠性和设计成功率。
-
使用Blender和Unreal Engine可视化驱动蛋白运动
一位Reddit用户分享了一个项目，该项目利用Blender和Unreal Engine可视化了ATP驱动的驱动蛋白运动。动画是使用来自RCSB蛋白质数据库的模型创建的。创作者提到大部分工作使用了Astra，但在其Plus订阅到期后，切换到Fable 5.1来处理特定的Unreal Engine任务。
-
北大发布开源 Claude Science 替代品 OpenAI4S
北京大学和元空间 AI Agent Lab 的研究人员发布了 OpenAI4S，这是一个开源的科学研究代理，模仿了 Anthropic 的闭源 Claude Science 的能力。这个新的代理在 MIT 许可下可用，专注于“代码即行动”的方法，允许 AI 在持久环境中直接生成和执行 Python 或 R 代码。OpenAI4S 旨在将 AI 集成到完整的科研工作流程中，从数据检索和分析到报告生成，并高度重视使用真实数据和计算，避免捏造结果。
-
人工智能帮助台使用 RAG 和 GPT-4.1-mini 为蛋白质结构沉积提供支持
研究人员开发了一个由人工智能驱动的帮助台系统，以协助结构生物学家将大分子结构沉积到蛋白质数据库（PDB）中。该系统利用检索增强生成（RAG）和 GPT-4.1-mini 以及 PostgreSQL 数据库，提供全天候支持。它旨在处理日益增长的沉积者咨询量，提供有引文支持的回复，并过滤掉不相关的查询。