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ProteinMPNN
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RosettaSearch 使用 LLM 优化蛋白质序列设计，保真度提高高达 68%
研究人员开发了 RosettaSearch，一种新颖的方法，它使用大型语言模型作为蛋白质序列设计的生成优化器。该方法将 LLM 集成到搜索算法中，该算法利用来自 RosettaFold3 等结构预测模型的奖励来探索和优化蛋白质序列。在评估中，与现有方法相比，RosettaSearch 在结构保真度和设计成功率方面均有显著提高，证明了其在不同 LLM 系列和蛋白质结构上的有效性。
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AI帮助科学家改造细菌，使其仅靠19种氨基酸生存
研究人员利用AI研究生命的基本构成单元，特别是蛋白质。通过采用AI指导的蛋白质设计，科学家们改造出一种大肠杆菌菌株，使其能够以减少的19种氨基酸（而非通常的20种）生存。该实验表明，核糖体等基本生物机器可以容忍简化，可能为早期生命的化学提供见解。