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TOOL · CL_231448 · Sep 2 · 04:00

新的PopPert框架可从非配对单细胞数据预测细胞反应

研究人员开发了PopPert，一个用于预测基因和化学扰动对细胞反应的新框架。与需要细胞间对应关系的先前方法不同，PopPert对群体级别的联合基因表达分布进行建模，使其适用于非配对单细胞数据。该框架利用高斯Copula捕捉基因共表达模式，并在差异表达恢复和扰动效应估计的基准测试中表现出优越的性能。PopPert的代码是公开可用的。