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Stable-Shift 方法利用生物学背景预测基因反应

研究人员开发了 Stable-Shift，一种预测基因表达如何响应基因扰动的新方法，即使对于训练期间未见的基因也是如此。该方法利用图卷积整合了各种生物学背景，包括蛋白质-蛋白质相互作用和基因注释。在 K562 Perturb-seq 数据上的基准测试中，Stable-Shift 在预测基因反应方面优于 GEARS 等现有方法，展示了其在减少功能基因组学实验负担方面的潜力。