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TOOL · CL_117819 · Jun 30 · 04:00

新系统将论文中的生物信息学工具链接到代码以实现可复现性

研究人员开发了 CoPaLink，这是一个旨在提高生物信息学工作流可复现性的自动化系统。该方法将科学论文中提到的生物信息学工具与其对应的可执行代码链接起来。CoPaLink 集成了科学文本和代码的命名实体识别，以及基于词嵌入相似度的实体解析，在 Nextflow 工作流上实现了 66% 的联合准确率。