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Neural Optimal Transport
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新的神经最优传输模型可从分子结构预测细胞表型
研究人员开发了一种新颖的条件神经最优传输(NOT)模型,用于从分子结构预测细胞表型。该方法通过学习使用分子结构作为条件信息将阴性对照表型映射到诱导表型,解决了穷尽实验表征的不可行性。NOT模型采用Monge-Gap正则化目标进行训练,通过减少技术变异和恢复分子特异性表型效应,在未见过分子的数据集上表现优于基线方法。研究将分子编码器确定为泛化能力的关键限制因素,表明改进的分子表示对于增强分布外性能至关重要。
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新框架对度量图上的概率分布进行建模
研究人员开发了一个新颖的深度生成建模框架,用于度量图上的概率分布。该方法将图嵌入到环境空间中以解决最优传输问题,然后将生成的样本投影回图上。与启发式基线相比,该方法在可扩展性和性能方面均有所提高,尤其是在真实世界的城市出行数据上。