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Mitochondrial E3 ubiquitin protein ligase 1
Mitochondrial E3 ubiquitin protein ligase 1
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DegradeQuery框架通过对立元组预训练提升PROTAC降解预测能力
研究人员开发了DegradeQuery，一个用于预测PROTAC诱导的蛋白质降解的新框架。该方法通过对立元组目标，将公共数据库中未充分利用的、缺少标签的记录转化为预训练信号。这种方法使模型能够在没有明确活性标签的情况下学习上下文关联。当应用于PROTAC-8K基准测试时，DegradeQuery取得了0.9065的AUC和0.8500的准确率，优于现有方法。
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TriGlue：用于分子胶设计的受生物学启发的生成模型
研究人员推出 TriGlue，这是一种受生物机制启发的、用于设计分子胶的新型生成模型。该模型解决了分子胶设计的复杂挑战，需要同时考虑配体生成、蛋白质-蛋白质对接和三元复合物组装。TriGlue 将此过程分解为界面估计和界面条件复合物生成，利用 SE(3)-等变模块和流匹配网络来生成有效的分子和合理的三元复合物，从而可能加速新型分子胶的发现。