Jeffrey D Varner

新方法使用随机注意力条件化蛋白质生成

研究人员开发了一种新颖的通过无训练随机注意力采样器条件化蛋白质生成的方法。通过将多样性比率纳入采样器的logits中，可以将生成过程从广泛的蛋白质家族转移到特定的目标子集。该技术在五个Pfam家族中进行了测试，结果表明注意力机制准确地遵循了分析目标，尽管特定残基标记的恢复取决于通过主成分分析分离指定序列和背景序列。加权剖面HMM显示了更直接的标记恢复，而在涉及Kunitz序列的比较中，随机注意力实现了更低的困惑度。