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Hopfield energy

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  1. TOOL · CL_111779 ·

    新的无训练方法可从小型比对生成新颖的蛋白质序列

    研究人员开发了一种名为随机注意力(SA)的新型无训练方法,用于从小型比对家族生成蛋白质序列。与需要大量数据的传统深度学习模型不同,SA利用Hopfield能量模型和Langevin动力学进行采样,无需GPU或预训练。该方法在各种蛋白质家族中都取得了成功,生成的序列具有低组成发散度、新颖性和结构合理性,优于现有的Profile HMM和MSA Transformer等方法。SA能够从种子比对自动运行,并获得独立语言模型的有利评分,使其成…