Hi-C

BlockFormer 使用 Transformer 从交互图中推断基因组位置

研究人员开发了 BlockFormer，一种新颖的基于 Transformer 的架构，用于从交互图中推断参数。该方法特别适用于从全基因组染色体构象捕获数据（如 Hi-C）中识别着丝粒等问题。BlockFormer 通过利用共享结构和用于生成合成训练数据的自定义模拟器，有效地处理了实体数量和大小的可变性。该方法在恢复不同物种的着丝粒基因组位置方面表现出准确性。