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GCP-VQVAE Lite

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TOOL · CL_283739 · Oct 2 · 00:00

新的潜在蛋白质语言提升自回归生成模型

研究人员开发了两种新颖的潜在蛋白质语言：蛋白质潜在语言（PLL）和结构潜在语言（SLL），旨在改进用于蛋白质序列和结构生成的自回归Transformer模型。PLL将序列映射到源自ESM-2编码器的上下文字母表，而SLL则调整VQ-VAE模型来表示骨架几何。当作为自回归模型（PLLM和SLLM）进行训练时，与传统的氨基酸分词相比，这些语言在计算扩展指数方面有所提高，并显著减少了低复杂度生成。SLL在序列到结构预测的验证困惑度方面也有显…