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FreeSolv: a database of experimental and calculated hydration free energies, with input files

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  1. TOOL · CL_160731 ·

    新的SenCos-GEM框架提高了分子属性预测的准确性

    研究人员开发了SenCos-GEM,一种新的分子表示学习框架,旨在提高分子属性预测的准确性。该方法利用余弦定理整合了物理引导的几何一致性,以创建鲁棒的3D空间先验,解决了现有方法中易受几何噪声和灾难性遗忘影响的局限性。SenCos-GEM还采用了轻量级SE模块和双调制预测头进行动态特征重新校准,在MoleculeNet等基准测试中取得了最先进的结果,尤其是在构象敏感回归任务上。

  2. TOOL · CL_100215 ·

    新的基准测试MolGraphBench评估用于分子回归任务的图神经网络

    一项名为MolGraphBench的新基准测试已被推出,用于评估用于分子回归任务的图神经网络(GNN)架构。该基准测试由Ishaan Gupta提出,分析了四种常见的GNN模型,发现图卷积网络(GCN)和图同构网络(GIN)表现最佳。研究还表明,在融合框架中,分子指纹可能与GNN不互补,并强调了将GNN层类型视为可调超参数以获得更优性能的重要性。