EpiAwareNet

新型Transformer模型增强基因调控网络推断

研究人员开发了EpiAwareNet，一个利用多组学Transformer从单细胞数据推断基因调控网络（GRNs）的新颖框架。该方法整合了转录组学和染色质可及性信息，克服了数据稀疏性和依赖固定基因-峰值链接等挑战。EpiAwareNet采用基因-峰值交叉注意力模块进行自适应信号聚合，并整合来自批量数据的先验GRN作为弱监督，增强了生物学合理性，并提高了现有方法的重建准确性。