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ECFP-16

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TOOL · CL_229290 · Sep 1 · 04:00

肽-蛋白亲和力模型在不同数据移位下进行基准测试

研究人员对各种肽表示法和回归器在预测肽-蛋白亲和力方面的性能进行了基准测试，结果表明，根据评估是否涉及肽相似性移位、靶点内预测或留靶点出场景，模型性能差异很大。在 60 种配置中，平均 Spearman 相关系数在 0.462 到 0.669 之间。研究发现，ECFP-16 指纹与随机森林回归器在插值和靶点内预测方面表现最佳，而在排除靶点序列时，HELM-BERT 嵌入与 Extra Trees 表现最佳。研究结果表明，肽-蛋白亲和力…