DBMol

DBMol框架利用结构预测进行靶向小分子设计

研究人员推出了一种新颖的框架DBMol，用于设计对特定蛋白质靶点具有高亲和力的小分子。该方法利用AlphaFold-3和Boltz-2等先进的结构预测模型来优化分子相互作用和结合亲和力。DBMol采用交替优化和投影过程，使用基于梯度的优化来增强口袋特异性相互作用，并使用流匹配模型生成化学上有效的小分子。实验表明，DBMol在没有参考配体监督的情况下，也能提高口袋覆盖率和分子多样性，同时在预留指标上保持有竞争力的性能。