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实体 Chignolin

Chignolin

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  1. TOOL · CL_204038 ·

    新的随机策略增强了分子模拟路径采样

    研究人员开发了两种新的随机控制策略,FS-TPS 和 LaS-TPS,以提高分子动力学模拟中过渡路径采样 (TPS) 的鲁棒性和效率。这些方法旨在通过在显式模拟中学习控制力来生成更具物理合理性的稀有分子过渡轨迹。在丙氨酸二肽、chignolin 和 BBL 蛋白系统上进行的广泛实验表明,与确定性基线相比,随机策略在提高过渡成功率和路径质量方面表现一致,同时显著降低了对初始条件的敏感性。

  2. TOOL · CL_199938 ·

    新的Functional Adjoint Sampler可在无限维度空间中实现可扩展采样

    研究人员推出了一种新的方法——Functional Adjoint Sampler (FAS),用于从无限维度函数空间中的Gibbs分布进行采样。该技术基于Adjoint Sampling,并利用随机最优控制理论来高效模拟扩散过程的轨迹,特别是在罕见事件或边界约束的情况下。FAS在合成势能和真实分子系统(如Alanine Dipeptide和Chignolin)的过渡路径采样方面表现出卓越的性能。