biological discovery

GNNs 创建层级感知的知识图谱嵌入用于酵母表型预测

研究人员开发了一种新颖的方法，使用图神经网络（GNNs）为知识图谱创建层级感知的嵌入。该方法结合了源自本体的语义损失，以更好地表示领域知识。该方法应用于预测酵母表型，在双基因敲除实验中取得了 0.360 的平均 R^2 分数，优于基线模型。结合语义损失进一步将预测性能提高到 R^2=0.377，证明了本体结构在定量预测中的价值，并可能指导生物学发现。