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Arya Hadizadeh Moghaddam
Arya Hadizadeh Moghaddam
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SoftGene框架使用蛋白质语言模型进行基因集注释
研究人员开发了SoftGene，一个利用蛋白质语言模型和混合提示方案增强基因集注释的新框架。该方法整合了蛋白质序列信息和由本地LLM生成的辅助上下文，以提高功能基因组学分析的可解释性和准确性。在Gene Ontology和MSigDB等基准数据集上的评估表明，SoftGene结合蛋白质嵌入和文本上下文的方法在各种生物学领域都具有优势。
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新AI方法优化电子健康记录结果预测的临床笔记摘要
研究人员开发了一种名为RASPER（用于电子健康记录预测的奖励对齐摘要器）的新方法，以改进用于预测患者结果的临床笔记摘要。该方法使用通过强化学习训练的可调LLM摘要器，奖励来自下游预测器的性能。RASPER旨在从非结构化笔记中提取与任务相关的证据，以补充结构化医疗代码，在MIMIC-III和MIMIC-IV数据集的再入院预测和药物推荐任务上优于现有方法。