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RESEARCH · CL_23549 · May 8 · 21:32

Scanpy教程指导对PBMC数据进行高级单细胞RNA测序分析

本教程详细介绍了如何使用Scanpy库执行高级单细胞RNA测序分析。该过程包括加载和清理PBMC数据集，识别和去除低质量细胞及潜在的双联体，然后对数据进行标准化和转换。分析包括降维、使用Leiden算法进行细胞聚类，以及使用标记基因注释细胞群。最后，工作流程将探索细胞轨迹结构并计算自定义分数，然后保存分析后的数据。