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实体 Alanine Dipeptide

Alanine Dipeptide

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  1. TOOL · CL_119469 ·

    新框架使分子扩散模型具有热力学解释性

    研究人员为分子扩散模型开发了一种新颖的作用算子框架,为解释其学习到的表示提供了数学上一致的方法。该框架允许直接从模型的输出来读出热力学量,例如自由能差。在分子系统上的实验表明,引入物理偏差有助于恢复基本作用和扰动算子,从而在具有挑战性的场景中也能实现准确的自由能估计。

  2. RESEARCH · CL_62313 ·

    新的SITA方法可实现高效分子采样

    研究人员开发了一种名为可扩展推理时间退火(SITA)的新方法,可高效地对分子玻尔兹曼分布进行采样。SITA利用基于流的模型和基于能量的代理来估计重要性权重,从而避免了计算成本高昂的散度计算。该方法在丙氨酸二肽和三肽等分子系统上表现出最先进的性能,为复杂的模拟提供了一种更易于处理的解决方案。