English(EN) Data-Scarce, Multi-Granular, Multimodal: Benchmark Design for Biosynthetic Gene Clusters

新的基准 BGC-Bench 增强了基因簇 AI 模型的评估

作者 PulseAugur 编辑部 · [1 个来源] · 2026-11-14 05:00

研究人员推出了 BGC-Bench，一个旨在严格评估用于分析生物合成基因簇 (BGCs) 的深度学习模型的新框架。该基准通过提供区分性任务并涵盖科学上有意义的应用，解决了现有方法的局限性。BGC-Bench 包括五个源自 MIBiG 数据集的任务，在各种泛化条件下评估模型，并纳入了用于数据稀疏发现的主动学习设置，使其能够扩展到新任务和编码器。 AI

影响增强了生物信息学中 AI 模型的评估，可能加速抗生素开发等领域的发现。

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arXiv cs.AI TIER_1 English(EN) · Hanlin Xiao, Eriko Takano, Mauricio A. \'Alvarez, Rainer Breitling · 2026-11-14 05:00

数据稀疏、多粒度、多模态：生物合成基因簇的基准设计

arXiv:2611.02275v2 Announce Type: replace Abstract: Biosynthetic gene clusters (BGCs) are co-located genes that encode the biosynthesis of specialized metabolites, an important source of antibiotics, anticancer agents, immunosuppressants, and agricultural bioactives. Deep learnin…

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