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English(EN) BioMiner: A Multi-modal System for Automated Mining of Protein-Ligand Bioactivity Data from Literature

BioMiner系统自动从文献中提取蛋白质-配体生物活性

研究人员开发了BioMiner,一个新颖的多模态系统,旨在自动从科学文献中提取蛋白质-配体生物活性数据。该系统通过解释文本、表格和图中的语义信息并重建复杂的化学结构,解决了手动整理的挑战。BioMiner在生物活性三元组上达到了0.32的F1分数,并在构建预训练数据库、改进定量结构-活性关系(QSAR)模型和加速生物活性注释方面展示了实际效用。 AI

影响 自动从文献中提取关键生物活性数据,加速药物发现并提高下游模型性能。

排序理由 这是一篇研究论文,描述了一个用于从科学文献中自动提取数据的新系统和基准。

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BioMiner系统自动从文献中提取蛋白质-配体生物活性

报道来源 [1]

  1. arXiv cs.AI TIER_1 English(EN) · Enhong Chen ·

    BioMiner:从文献中自动化挖掘蛋白质-配体生物活性数据的多模态系统

    Protein-ligand bioactivity data published in the literature are essential for drug discovery, yet manual curation struggles to keep pace with rapidly growing literature. Automated bioactivity extraction remains challenging because it requires not only interpreting biochemical sem…