研究人员开发了一种图神经网络(GNN)来近似系统发育树之间的子树剪切和嫁接(SPR)距离。该方法旨在在训练后提供近乎恒定的计算时间,以解决大型数据集中精确SPR距离计算的NP-hard性质。该研究发布了一个包含864棵系统发育树的数据集,并验证了一种与精确SPR距离高度相关的启发式方法,在分布内数据上实现了约87-90%的方差解释率。 AI
影响 这项研究可以实现对大规模系统发育数据的更快分析,从而可能加速流行病动力学等领域的研究。
排序理由 这是一篇研究论文,详细介绍了一种使用机器学习近似复杂生物计算的新方法。[lever_c_demoted from research: ic=1 ai=1.0]
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